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His標(biāo)簽蛋白純化問(wèn)題解析

2020-11-13

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1. 通過(guò)His標(biāo)簽純化的蛋白,雜質(zhì)比較多?

可能原因1:蛋白酶會(huì)部分降解目的蛋白

解決方法:加入多種蛋白酶抑制劑改進(jìn)。

可能原因2:雜質(zhì)蛋白與鎳柱親和力較強(qiáng)

解決方法:可提高雜質(zhì)蛋白與鎳柱結(jié)合起始咪唑濃度。

可能原因3:雜蛋白和目的蛋白結(jié)合

解決方法:可通過(guò)超聲前加入去垢劑或者還原劑消除(1%-2%Tritonx-100)。

可能原因4:洗滌不充分

解決方法:增加洗滌的次數(shù),充分洗滌。

2. 融合蛋白不掛金屬螯合親和層析柱?

可能原因1:超聲的功率不對(duì)(太大,蛋白炭化,太小,蛋白沒(méi)有釋放)

解決方法:改變超聲功率或超聲前嘗試添加溶菌酶增加細(xì)胞破碎率。

可能原因2:組氨酸標(biāo)簽暴露不完全

解決方法:在變性條件下(用4-8 M 脲,或4-6 M 鹽酸胍)進(jìn)行純化,常規(guī)Ni-6FF(IDA) ,在變性條件下鎳離子容易脫落,此時(shí)可選擇耐受變性劑的螯合填料(推薦月旭材料的親和填料Ni Tanrose FF(NTA))。

可能原因3:His標(biāo)簽丟失

解決方法:

1.WB 檢查His是否表達(dá),上游構(gòu)建,改變His-tag的位置(C- 端或N- 端),必要時(shí)增加His個(gè)數(shù);

2.孵育的時(shí)間不夠,降低流速和增加孵育的時(shí)間;

3.改變螯合的金屬離子,尋找到z jia的結(jié)合金屬離子;

4.選擇高載量高特異性的螯合填料(月旭材料的親和填料 Ni Tanrose FF(IDA) )。

3. 使用幾次后Ni柱載量下降,掛柱效率低,如何處理?

可能原因:逐漸積累沉淀,變性或非特異結(jié)合的蛋白占據(jù)了有效的結(jié)合位點(diǎn),而通過(guò)洗脫液無(wú)法徹底清洗所致

解決方法:

較溫和的清洗方法:用2倍柱體積的6M鹽酸胍或8M尿素洗滌,然后用5倍體積的緩沖液洗滌,以去除沉淀或變性物質(zhì)。用2倍柱體積的1% Triton X-100洗滌,然后用5倍柱體積的緩沖液洗滌,以去除疏水結(jié)合的物質(zhì)。若改變不明顯,可選擇強(qiáng)烈清洗方式。

強(qiáng)烈清洗方式:首先用5-10倍柱體積的脫鎳緩沖液(20 mM 磷酸鈉, 0.5 M NaCl, 50 mM EDTA, pH 7.4)洗滌,進(jìn)行脫鎳操作,然后用5-10倍柱體積的平衡緩沖液沖洗,更后用5-10倍柱體積的雙蒸水沖洗;隨后進(jìn)行清洗操作,去除離子型雜蛋白,可以用5倍柱體積的1.5 M NaCl溶液,然后10倍柱體積的雙蒸水沖洗;去除沉淀或變性蛋白,可以用1M氫氧化鈉溶液,結(jié)合1-2小時(shí),然后用10倍柱體積的平衡緩沖液和10倍柱體積的雙蒸水迚行沖洗;去除疏水蛋白或者脂蛋白,可以用5-10倍柱體積的30%異丙醇溶液清洗,然后10倍柱體積的雙蒸水洗滌;更后進(jìn)行生鎳操作,用0.1M硫酸鎳上柱,隨后5倍柱體積的雙蒸水和平衡緩沖液迚行洗滌,如需保存,保存在20%乙醇溶液。

4. 融合蛋白結(jié)合在螯合填料上洗脫不下來(lái)?

可能原因1:洗脫條件太溫和(融合蛋白質(zhì)仍然結(jié)合在柱上,結(jié)合力較強(qiáng))

解決方法:增加咪唑的梯度洗脫或降低pH來(lái)找出z jia的洗脫條件。

可能原因2:降低pH的方法洗脫,若pH低于3.5,會(huì)導(dǎo)致鎳離子脫落

解決方法:改變洗脫辦法,咪唑競(jìng)爭(zhēng)性洗脫。

可能原因3:蛋白已沉淀在柱上

解決方法:

1. 減少上樣量,或使用咪唑的線(xiàn)性梯度而不是分步洗脫以降低蛋白的濃度。試用去污劑或改變NaCl的濃度,或在變性條件(去折疊)下洗脫(用4-8 M 脲,或4-6 M 鹽酸胍);

2. 蛋白在柱上變性固化,用0.5M氫氧化鈉洗柱。

可能原因4:非特異性疏水或其他相互作用

解決方法:加非離子去污劑到洗脫緩沖液(如:2% Triton X-100)或增加NaCl的濃度。

可能原因5:在填料表面形成高密度融合蛋白的聚集

解決方法:選擇合適載量的填料,切勿一味追求高載量。

5. 使用過(guò)程中發(fā)現(xiàn)堵塞嚴(yán)重,且流速越來(lái)越慢?

可能原因:樣品中細(xì)胞碎片或其他雜顆粒所致

解決方法:樣品處理過(guò)程中,高速離心,z hao用0.45um的濾膜過(guò)濾(推薦)。如果柱子堵塞嚴(yán)重,重生時(shí)使用1% Triton X-100/PBS浸泡過(guò)夜。流速慢,可在柱子下面接一根軟管。

6. 鎳柱使用中出現(xiàn)棕色是怎么回事?

可能原因:緩沖液中DTT的影響, DTT會(huì)對(duì)鎳柱的顏色和純化效率有很大的影響,在堿性的緩沖液條件下,鎳離子會(huì)被DTT還原生成棕色的沉淀,所以要盡量避免DTT的參與

解決方法:若樣品中含有DTT,在上樣之前, 我們推薦采用不含還原性試劑的空白運(yùn)行來(lái)除去任何較弱結(jié)合的鎳離子;空白運(yùn)行方法(使用不含還原劑的平衡液和洗脫液)

1)5倍柱體積的雙蒸水洗柱;

2)5倍柱體積的平衡液洗柱;

3)5倍柱體積的洗脫液洗柱;

4)10倍柱體積的平衡液平衡。

當(dāng)不使用時(shí),勿將Ni Tanrose 6FF(IDA)保存于含還原性試劑的緩沖液中。

7. 上清渾濁,是用IDA好還是NTA好?

上清渾濁,推薦適當(dāng)稀釋上清,并再次離心或者過(guò)0.45um濾膜處理。Ni Tanrose 6FF(IDA)或Ni Tanrose 6FF(NTA)都可純化。

8. 填料是否可以重復(fù)使用?可以使用多少次?

如果維護(hù)的好的話(huà),填料在其效期之內(nèi)可以一直重復(fù)使用。如果每次都是純化同樣的蛋白就沒(méi)有必要?jiǎng)冸x掉鎳離子重新掛鎳,一般經(jīng)過(guò)5-7次純化之后可以進(jìn)行脫鎳和再生鎳的操作。如果柱子反壓高了,填料需要做徹底的在位清洗CIP,在清洗之前,為了避免金屬鹽的沉淀,需要?jiǎng)冸x掉鎳離子,然后再重新掛鎳,清洗后保存在20%的乙醇中。填料的壽命因使用的環(huán)境,純化的樣品的特性,保存方式等都有直接關(guān)系。

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